环境工程微生物学 备课笔记 新.doc
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1、绪论1:什么是微生物学? 研究微生物的“衣食住行”的科学。 形态、结构、营养、代谢或称生理、环境影响或称生态、能有何种行为、作为?是敌是友?如何监测、控制或使用呢?2:什么是环境工程微生物学?与环境保护技术相关的微生物学知识。偏重于水环境保护,是本专业环境工程的基础课。 有害微生物(病原性、腐蚀性)的监控与防治有益微生物培养与利用(水处理中的各种微生物的高效、密集培养、强化生物去污)3:环境问题的根源何在?人祸,观念的错误; “征服自然改造自然”人与环境的极端对立4:如何解决环境问题?治本纠正错误观念走可持续发展战略(天地人和)5:微生物 微生物的发现:1676年,荷兰,列文虎克,单式显微镜微
2、生物(microorgaism, microbio)的定义微生物是所有形体微小的单细胞或个体结构较简单的多细胞,以及没有细胞结构的低等生物的通称;肉眼看不到的,必须在电子显微镜或光学显微镜才能看见的所有微小生物的统称。 微生物仅是一个人为的分类名称。 微生物的种类非细胞型:病毒、亚病毒(类病毒,拟病毒,朊病毒)细胞型:原核生物(古生菌,真细菌)、真核生物(真菌,单细胞藻类,原生动物)6:微生物的分类和命名:分类方法在生物学上,对生物的分类采用按其生物属性和它们的亲缘关系有次序地分门别类排列成一个系统。:七个等级:界、门、纲、目、科、属、种。每一种生物,包括微生物,都可在这个系统中找到相应的位置
3、。其中种(species)是分类的基本单位。必要时,还可以在这些等级之间再增设一些亚等级。微生物的命名 瑞典植物学家林奈在分类学上最大的贡献是创立双名法,解决生物名称的纠纷。1. 学名=属名+种名+(首次定名人)+现定名人+定名年份2 .学名=属名+种名+菌株(用字母、符号等字形表示)3.学名=属名+sp.(或spp.) 7:微生物的特点 (一) 个体极小,比表面积大;(二)代谢速率快、繁殖快;(三)数量多;(四)易变异;(五) 种类多、分布广、代谢类型多样8:微生物学与环境工程微生物学微生物学定义 是一门在细胞、分子或群体水平上研究微生物的形态构造、生理代谢、遗传变异、生态分布和分类进化等生
4、命活动基本规律,并将其应用于工业发酵、医药卫生、生物工程和环境保护等实践领域的科学。环境工程微生物学研究内容:自然环境中微生物的基础知识;自然环境中的微生物生态学研究;污染环境中的微生物生态学研究;废弃物生物处理中微生物学原理和方法的研究;生物膜法;活性污泥法研究任务:充分利用有益微生物资源为人类造福,防止、控制、消除微生物的有害活动,化害为利。第一章 原核生物的形态、结构和功能第一节 细菌细菌是一类细胞细短、结构简单、胞壁坚韧、多以二分裂方式繁殖和水生性较强的原核生物。1.1 细菌的形态和大小一、球菌球菌就是球形的细菌,它是这类细菌的总称,细胞呈球形或椭圆形。 l 单球菌;2 双球菌;3链球
5、菌; 4 四联球菌;5八叠球菌;6 葡萄球菌二、杆菌细胞呈杆状或圆柱状,菌体直或稍弯,粗短或细长。末端钝圆、尖、膨大或平裁状。w 直径在0.51um15um(宽径长)三、弧菌弧菌细胞呈弧形,其中若菌体多于一个弯曲,其程度超过一圈,又称为螺旋菌。直径在0.55um,长度不等。2.1 细菌的一般构造指细菌都具有的构造,包括细胞壁、细胞膜、细胞质及其内含物、核区等。 1. 细胞壁固定细胞外形;保护细胞免受外力的损伤;阻拦大分子物质进人细胞使某些细菌具有致病性及对噬菌体的敏感性。革兰氏染色法1.涂片固定;2.单染结晶紫染液第一次染色 1mi ;3.媒染碘-碘化钾溶液浸湿30S;4. 脱色95%乙醇溶液
6、进行颜色洗脱;5.复染红色的藩红染液紫色,革兰氏阳性菌(紫阳G);红色;称革兰氏阴性菌(红阴G -)2. 细胞膜(原生质体)紧贴在细胞壁的内侧而包围细胞质的一层柔软而富有弹性的半渗透膜。化学组成:脂质(2030)蛋白质(6070)结构:极性磷脂双分子层3. 细胞质细胞膜内除拟核以外的所有无色透明、呈粘胶状物质。(1)核糖体:多肽和蛋白质的合成场所。(2)细胞内含物1)气泡(水生细菌):相当于鱼的鱼漂2)异染颗粒:蓝色侵染呈紫红色。(偏磷酸盐的聚合物)磷源和能源性贮藏物,3)聚-羟基丁酸(简称 PHB)颗粒 能量的贮存物;调节pH4)糖原和淀粉粒5)硫粒 某些化能自养型硫细菌,贮存的能源物质4.
7、 核质体原核生物所特有的原始细胞核。w 细菌的核质体是一个大型环状的双链DA分子,长度025mm3mm,为细菌遗传物质,卷曲折叠于核区。核区没有外膜(这是原核生物与真核生物一个主要的区别之处)2.2 细菌的特殊构造5. 荚膜是某些细菌在新陈代谢过程中形成的,分泌于细胞壁外的粘液状物质。含水率在9098,极难染色;多糖 、糖蛋白单染后墨汁背景衬托法观察,多出现在“中老年细菌”外围。功能: 储备粮; 生物吸附菌胶团多个菌体外面的荚膜物质互相融合,连为一体,组成共同的荚膜,菌体包埋其中,即成为菌胶团。 菌胶团吸附物(物质、其他微生物)活性污泥群体合作、阻挡原生动物的吞噬6. 鞭毛(蛋白质)往往长度超
8、过菌体若干倍,但直径很细。 细菌藉鞭毛趋避运动鞭毛的着生方式和数目是细菌分类鉴定的重要指标。7. 菌毛纤细、中空、短直、数量较多(250300) 相当于各类禽兽的体表的毛发。或称性丝,每一个有性细菌有1根4根,参与细菌有性生殖时细菌间传递遗传物质。8. 芽孢某些细菌当环境恶劣时,细胞质浓缩凝集,逐步形成一个圆形、椭圆形或圆柱形的休眠体,称为芽孢。1)多层结构功能由内至外,依次为芽孢外壁 芽胞衣,主要成分是角蛋白,非常致密,通透性差,能够阻止各类化学物质包括杀菌剂的进入;皮层,很厚,主要成分为芽孢特有的肽聚糖,其中含有一种特殊的物质吡啶二羧酸以及大量的Ca2+,二者形成了一种极为耐热的凝胶状物质
9、,使得芽孢菌异常抗热,在沸水中芽孢也可存活数小时。芽孢质中含水量极低,细胞内代谢极为缓慢,处于休眠状态。多层作用使芽孢对高温、干燥、辐射、酸、碱和有机溶剂等杀菌因子具有极强抵抗能力芽孢“复苏”合适的环境中,恢复普通的细胞结构,失去各类抵抗功能。能形成芽孢的细菌种类不多,最主要的是芽孢杆菌属(Bacillus)和梭菌属(Cletridium),它们都是革兰氏阳性菌。2)形成过程w 产芽孢菌通常在养料耗尽时停止生长形成芽孢,芽孢的形成对于产芽孢菌度过困境有着极为重要的意义,芽孢可在普通条件下保存几年甚至几十年都依然可以复活。在实验室进行灭菌处理时,由于芽孢最难杀死,灭菌手段主要考虑的是杀灭芽孢;芽
10、孢菌普遍存在于处理各类有毒废水中,并对水质净化起着十分重要的作用。1.4 细菌的繁殖(一)无性生殖w 细菌的繁殖方式很多,主要是以无性的二分裂繁殖(二)有性生殖w各类细菌普遍具有有性生殖能力 极少数个体可以进行,大约只占0.11%。但这却有着十分重要的生物学意义种内进化、种间合作共生;特有的抗性基因可以传递给另一些种类的细菌1.5 细菌的菌落特征固体培养基上的各种菌类的“村落”。w 固体培养基固体状态的培养细菌的基质w 有的是天然物质,如土豆、馒头及其他各种固体食物,微生物学研究中多使用人工制作的固体琼脂培养基。培养皿通常称平板。细菌在培养基上生长,会形成各种颜色和外观的菌落。w 菌落的特征主
11、要由各种微生物特殊的遗传特性决定,同时也与培养基成分及培养条件有关当固定培养基成分及培养条件相同时,不同种类微生物形成的菌落特征是固定的,可作为微生物鉴定的重要依据。没有鞭毛不运动的细菌,特别是球菌,常形成较小、较厚、边缘较整齐的菌落;有鞭毛的细菌则较大而扁平,边缘波状、锯齿状等;有荚膜的细菌菌落较大并且表面光滑,而没有荚膜的则表面较粗糙;具有芽孢的细菌菌落表面常有褶皱并且不透明。a.隆起特征描述 b.边缘特征描述 c.表面特征描述细菌菌落具有一些共同的特征:小、湿润、粘稠、与基质结合松散,易被剥离,质地均匀,各部位颜色一致。但不同的细菌菌落也具有自己特有的特征。在液体中群体细菌的生存形式随密
12、度不同,在液体培养基表面形成膜(轻);使培养液混浊(中);产生絮状沉淀(粘重,如菌胶团、活性污泥)。第二节 放线菌的形态、结构和功能(一)放线菌的形态、大小和繁殖特征:丝状分枝、菌丝:营养菌丝、气生菌丝、孢子丝繁殖:通过分生孢子或孢囊孢子繁殖,也可以一段营养菌丝繁殖(二)、鉴定特征及生理特性 菌落特征 (与细菌特征正好相反)表面常呈粉末状或皱褶状,有的则呈紧密干硬的圆形,有些为糊状。颜色各异,正反不同,质地紧密,菌落不易用接种环挑起,较小 。 液体培养特征静置培养:培养基不混浊膜状附壁,或沉降于底部。震荡(或摇床)培养:短的菌丝体构成球状颗粒。生理特性: 大多数好氧,最适宜的pH值78,嗜中温
13、。环保应用举例:降解木质素和纤维素第三节 蓝细菌蓝藻或蓝绿藻 含有光合色素,能进行光合作用并产氧的原核生物。1、结构和形态 球状、杆状、长丝状、分枝丝状2、特殊结构异形胞固氮的场所;粘液趋光趋向性;气泡趋光趋向性3、营养类型 光能自养4、繁殖 无性生殖单细胞:二分裂、多次分裂、顶端释放(芽殖)丝状体:中间分裂、无规则分裂、顶端释放(芽殖)应用: 处理高浓度有机废水(含氨氮高) 饲料添加剂弊: 富营养化:人类活动使江河、湖泊中生物所需的N、P等营养物质短期内大量增加,引起藻类和浮游生物的迅速繁殖,导致水中溶解氧下降,水质恶化,鱼类和其它生物死亡。利: 自然水体自净(污水处理氧化塘) 藻类光合作用
14、释放氧气,为好氧微生物提供有氧环境,保证水中的有机污染物好氧降解连续进行,周而复始的分解光合使水体净化。 富集重金属离子:利用其生物吸附作用可从工业污水中去除有毒、放射性金属和回收稀有、贵重金属。该法具有高效、经济、简便、选择性好等优点 ,尤其适用于低浓度及一般方法不易去除的金属。主要菌种有菌藻共生体、啤酒酵母菌、盐泽螺旋藻、林可链霉素和黑根霉菌生物固氮作用微生物在常温常压下直接利用分子氮(2),将之还原为氨(H3)的过程。第四节 支原体、立克次氏体和衣原体“三体”是属于革兰氏阴性的代谢能力差、主要营细胞内寄生的小型原核生物。介于细菌与病毒间的一类生物。 4.1 支 原 体定义:是一类无细胞壁
15、的原核生物,介于独立生活和细胞内寄生生活间的最小原核生物。多数为致病菌。特点:细胞很小,光镜下勉强可见;细胞膜含甾醇,比其他原核生物的膜更坚韧;无细胞壁,故呈革兰氏阴性且形态易变,对渗透压较敏感,对抑制细胞壁合成的抗生素不敏感;菌落小,在固体培养基表面呈特有的“油煎蛋”状;能在含血清、酵母膏和甾醇等营养丰富的培养基上生长。4.2 立克次氏体(Rickettsia)立克次氏体是大小介于通常的细菌与病毒之间,在许多方面类似细菌,专性活细胞内寄生的原核微生物。特 性 :(1)专性活细胞寄生物,除五日热立克次氏体外均不能在人工培养基上生长繁殖;(2) 体内酶系不完全,一些必需的养料需从宿主细胞获得;
16、(3)细胞膜比一般细菌的膜疏松; (4)可透性膜,使它们有可能容易从宿主细胞获得大分子物质,但也决定了它们一旦离开宿主细胞则易死亡 4.3 衣原体(Chlamydia)衣原体介于立克次氏体与病毒之间,能通过细菌滤器,专性活细胞内寄生的一类原核微生物。过去误认为“大病毒”,但它们的生物学特性更接近细菌而不同于病毒。 第二章 真核微生物的形态、结构和功能第一节 原生动物一、原生动物的一般特征(一)形态特征单细胞,没有细胞壁、大多无色透明;器官分化(运动、感觉、消化、捕食等等);行动胞器伪足、鞭毛和纤毛;消化、营养胞器胞口、胞咽、食物泡、吸管;排泄胞器收集管、伸缩泡、胞肛;视觉胞器眼点(二)营养类型
17、纯动物性 (大部分) “吞食”活细菌、真菌、藻类或有机颗粒植物+动物性 (极少数) 本质上是裸藻、金藻等,改名为植物性鞭毛虫;腐生性(大多)寄生性(三)繁殖通常无性繁殖二分裂、孢子当环境条件差时出现有性生殖基因重组,加快变异进化(四)原生动物的孢(或胞)囊当环境条件变坏(如水干枯、水温和pH过高或过低,溶解氧不足,缺乏食物,有机物浓度过高等等)情况下,原生动物抵抗不良环境的休眠体。鞭毛、纤毛等细胞器缩入体内,缩水,并分泌一种胶状物质于体表,凝固成孢壳,均为球状。(休眠、隔绝保护、较少接触面;孢囊很容易随灰尘漂浮或被其他动物带到其他地方,胞囊遇到适宜环境胞壳破裂,恢复虫体形状)二、分类及各纲简介
18、 根据原生动物的细胞器和其他特点,将原生动物分为四个纲,即肉足纲、鞭毛纲和纤毛纲、孢子纲。肉足纲 大多没有固定形状由体内细胞质不定方向的流动而呈现千姿百态,少数种类为球形。 细胞质可伸缩变动而形成伪足。作为运动和摄食的胞器。 典型种:变形虫、辐射变形虫、太阳虫、壳虫 可以任意改变形状的肉足类为根足变形虫,一般就叫做变形虫。还有一些体形不变的肉足类、呈球形,它的伪足呈针状,如辐射变形虫和太阳虫。规律:大量出现时预示出水水质差。如活性污泥驯化初期(游离细菌大量出现后)。鞭毛纲 形态:具有一根或一根以上的鞭毛 鞭毛长度大致与其体长相等或更长些,是运动器官,分为植物性鞭毛虫和动物性鞭毛虫。.植物性鞭毛
19、虫(兼有动物性营养)动物性鞭毛虫(常见的有波豆虫和滴虫等。) 形态:(原生动物中最小)长1122um,宽510um。 生活在腐化有机物较多的水体内。规律:与变形虫规律类似。纤毛纲 特征:周身表面或部分表面具有纤毛游动及摄食的工具。 纤毛虫喜吃游离细菌及有机颗粒,与废水生物处理的关系最为密切。纤毛虫是原生动物中构造最复杂的,不仅有比较明显的胞口,还有口围、口前庭和胞咽等吞食和消化的细胞器官。根据运动情况可分为游泳型、匍匐型、固着型和吸管虫四种。I. 游泳型纤毛虫自由游动如草履虫,豆形虫、肾形虫、漫游虫等。规律:预示出水较差,污泥驯化仍在继续 (常在鞭毛虫优势后出现) 。.匍匐型纤毛虫 匍匐在污泥
20、絮体上爬行或游动。常见为楯纤虫、尖毛虫、棘尾虫、游仆虫。.固着型纤毛虫1个体型 形态:个体或群生相连,固着在活性污泥上 喇叭虫、钟虫(更常见)A.前端有环状纤毛带 钟虫纤毛摆动时使水形成旋涡,把水中的细菌、有机颗粒引进胞口。食物在虫体内形成食物泡。当泡内食物逐渐被消化和吸收后,泡亦消失,剩下的残渣和水分渗入较大的伸缩泡。伸缩泡逐渐胀大,到一定程度即收缩,把泡内废物排出体外。伸缩泡只有一个,而食物泡的个数则随钟虫活力的旺盛程度而增减。B. 后端有尾柄靠尾柄附着在其它物质(如活性污泥、生物滤池的生物膜)上当环境不良时,柄消失,固着型钟虫成为游动性的常见的单个个体有领钟虫、小口钟虫(废水处理中出现频
21、率最大,数量也是最多)、沟钟虫。2群体型(“九头鸟”)固着型纤毛虫中的群体型生物有缩虫、盖虫、累枝虫三种。作用:可以降低水中游离细菌的数量,降低水的浑浊度,对废水生物处理起良好的促进作用;规律:固着虫大量出现预示出水水质好,污泥驯化佳。.吸管虫形态:幼虫有纤毛,成虫纤毛消失,长出长短不一的吸管,末端有一根柄固着生活,以其他原生动物为食。捕食蚊子式用吸管吸住微小动物,并由吸管中释放毒素将其麻醉,继而融化其细胞膜,吸干其体液。规律:预示出水水质好,污泥驯化佳。二、原生动物在废水生物处理中的作用 (一)净化废水作用直接参与废物的去除捕食水中的悬浮的有机废物颗粒(细菌主要吃溶解性污染物)吞噬细菌,净化
22、出水水质细菌(尤其使游离细菌)本身也是有机污染物;产生絮凝物质,促进活性污泥的形成活性污泥颗粒主要是由细菌絮凝而成,细菌生长到一定程度后就凝集成絮状物。这种絮状物为原生动物提供了着生的环境,反过来絮状物上的原生动物能加速絮凝过程。 实验证明小口钟虫、累枝虫和草履虫等纤毛虫能分泌一些粘性多糖,使他们能够附着在小的絮凝体上,同时促进絮凝体进一步黏附细菌使污泥絮体增大。 生产上常常发现在活性污泥培养初期,一旦处理系统中出现固着型纤毛虫,随后就可看到活性污泥絮体的形成并逐渐增大。(二) 指示生物作用依据原生动物数量、种类、优势种、个体活性与水质的相关规律。优越性.观察测量容易 .快速预报普遍规律.水质
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