第四章蛋白质化学课件.ppt
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1、第一节第一节 蛋白质的生物学功能蛋白质的生物学功能第二节第二节 蛋白质的分子组成蛋白质的分子组成第三节第三节 蛋白质的分子结构蛋白质的分子结构第四节第四节 蛋白质结构与功能的关系蛋白质结构与功能的关系第五节第五节 蛋白质的理化性质蛋白质的理化性质第一节第一节 蛋白质的生物学功能蛋白质的生物学功能 2.蛋白质具有重要的生物学功能蛋白质具有重要的生物学功能 3.氧化供能氧化供能第二节第二节 蛋白质的分子组成蛋白质的分子组成一、蛋白质的元素组成一、蛋白质的元素组成二、结构单位二、结构单位氨基酸氨基酸 1 1、结构、结构 2 2、分类、分类 3 3、性质、性质三、蛋白质的分类三、蛋白质的分类一、蛋白质
2、的元素组成一、蛋白质的元素组成1、主要元素:、主要元素:碳、氢、氧、氮和硫,有些蛋白碳、氢、氧、氮和硫,有些蛋白质还含有少量磷和金属元素。质还含有少量磷和金属元素。2、特点:、特点:各种蛋白质的含氮量很接近,平均含各种蛋白质的含氮量很接近,平均含氮量为氮量为16%。3、定氮法测定蛋白质含量:、定氮法测定蛋白质含量:蛋白质含量蛋白质含量6.25样品含氮量样品含氮量 二、结构单位二、结构单位氨基酸氨基酸(amino acid)1 1、结构、结构 此外,在此外,在2020种氨基酸中,只有脯氨酸种氨基酸中,只有脯氨酸是亚氨基酸,其它均为是亚氨基酸,其它均为氨基酸氨基酸2 2、分类、分类(1 1)必需氨
3、基酸和非必需氨基酸)必需氨基酸和非必需氨基酸 这些体内需要而又不能自身合成,必须这些体内需要而又不能自身合成,必须由食物供应的氨基酸,称为营养必需氨基由食物供应的氨基酸,称为营养必需氨基酸。人体必需氨基酸有八种:酸。人体必需氨基酸有八种:Met Trp Lys Val Ile Leu Phe ThrMet Trp Lys Val Ile Leu Phe Thr “假假 设设 来来 借借 一一 两两 本本 书书”(2 2)按标准氨基酸)按标准氨基酸R R基的结构和性质(特别基的结构和性质(特别是极性)及标准氨基酸在生理条件下的水是极性)及标准氨基酸在生理条件下的水溶性进行分类溶性进行分类NH2C
4、 HCHCOOHH3CCH3NH2C HCH3COOH丙氨酸丙氨酸(Ala)A缬氨酸缬氨酸(Val)VNH2C HCOOHCH2HCH3CCH3异亮氨酸异亮氨酸(Ile)INH2C HCOOHCHH3CCH3CH2亮氨酸亮氨酸(Leu)L1 1、非极性疏水、非极性疏水R R基氨基酸基氨基酸(九)九)COOHNH2C HH甘氨酸甘氨酸(Gly)GCOOHCHHNH2CCH2CH2脯氨酸脯氨酸(Pro)PCOOHCHH2NCH2CH2SCH3甲硫氨酸(甲硫氨酸(Met)MCOOHCHH2NCH2苯丙氨酸苯丙氨酸(Phe)FCOOHCHH2NCH2NH色氨酸色氨酸(Trp)WCOOHCHH2NCH2
5、OH酪氨酸酪氨酸(Tyr)Y2 2、极性不带电荷、极性不带电荷R R基氨基酸(六)基氨基酸(六)COOHCH2NHCH2OH丝氨酸丝氨酸(Ser)SCOOHCH2NHC OHHCH3苏氨酸苏氨酸(Thr)TCOOHCH2NHCH2SH半胱氨酸半胱氨酸(Cys)CCOOHCH2NHCH2CONH2天冬酰胺天冬酰胺(Asn)NCOOHCH2NHCH2CONH2CH2谷氨酰胺谷氨酰胺(Gln)Q3 3、性质、性质 (1 1)紫外吸收特征)紫外吸收特征 TrpTrp、TyrTyr和和PhePhe在在 280nm280nm波长附近具有最波长附近具有最大吸收峰,大吸收峰,TrpTrp的最大吸的最大吸收最接
6、近收最接近280nm280nm(2 2)两性解离)两性解离 等电点(等电点(isoelectricisoelectric point point,pI,pI):在某):在某一一pHpH环境中,氨基酸解离成阳性离子及阴环境中,氨基酸解离成阳性离子及阴性离子的趋势相等,所带性离子的趋势相等,所带净电荷为零净电荷为零,在,在电场中不泳动。此时,氨基酸所处环境的电场中不泳动。此时,氨基酸所处环境的pHpH值值称为该种氨基酸的等电点称为该种氨基酸的等电点(pI(pI)。带电状态判定:带电状态判定:pIpI-pH0 -pH0 -pH0 .带正电带正电 pIpI-pH-pH0 0 .不带电不带电(3 3)茚
7、三酮反应)茚三酮反应茚三酮在茚三酮在弱酸性弱酸性溶液中与溶液中与-氨基酸共热,氨基酸共热,氨基酸被氧化成醛、氨基酸被氧化成醛、CO2CO2和和NH3NH3,最后茚三,最后茚三酮与反应产物酮与反应产物氨和还原茚三酮发生作氨和还原茚三酮发生作用,生成用,生成蓝紫色蓝紫色化合物。该化合物在化合物。该化合物在570nm570nm处有一个吸收峰,可用于氨基酸的定量分处有一个吸收峰,可用于氨基酸的定量分析。析。两个亚氨基酸两个亚氨基酸脯氨酸和羟脯氨酸脯氨酸和羟脯氨酸与茚与茚三酮反应形成三酮反应形成黄色黄色化合物。化合物。NH3CO2 RCHO+还原性茚三酮还原性茚三酮+(弱酸弱酸)加热加热3H20氨基酸与
8、茚三酮反应氨基酸与茚三酮反应水合性茚三酮水合性茚三酮+2NH3+水合性茚三酮水合性茚三酮还原性茚三酮还原性茚三酮蓝紫色化合物蓝紫色化合物三、蛋白质的分类三、蛋白质的分类根据组成分为单纯蛋白质和缀合蛋白质(如脂蛋根据组成分为单纯蛋白质和缀合蛋白质(如脂蛋白、糖蛋白、核蛋白、金属蛋白)白、糖蛋白、核蛋白、金属蛋白)根据构象分为纤维状蛋白质和球状蛋白质根据构象分为纤维状蛋白质和球状蛋白质补充:补充:构象构象:是指具有相同结构式和相同构型的分子在空:是指具有相同结构式和相同构型的分子在空间里可能的多种形态,间里可能的多种形态,构象形态间的改变不涉及构象形态间的改变不涉及共价键的破裂。共价键的破裂。构型
9、构型:指在具有相同结构式的立体异构体中取代基指在具有相同结构式的立体异构体中取代基团在空间的相对取向,团在空间的相对取向,不同的构型如果没有共价不同的构型如果没有共价键的破裂是不能互变的。键的破裂是不能互变的。第三节第三节 蛋白质的分子结构蛋白质的分子结构一、肽一、肽二、蛋白质的一级结构二、蛋白质的一级结构三、蛋白质的二级结构三、蛋白质的二级结构四、蛋白质的三级结构四、蛋白质的三级结构五、蛋白质的四级结构五、蛋白质的四级结构六、维持蛋白质构象的化学键六、维持蛋白质构象的化学键一、肽一、肽 在蛋白质分子内,一在蛋白质分子内,一 个氨基酸的羧基与另个氨基酸的羧基与另 一个氨基酸的氨基之一个氨基酸的
10、氨基之 间失水形成的酰胺键间失水形成的酰胺键 称为称为肽键肽键,所形成的,所形成的 化合物称为化合物称为肽肽 肽键的形成肽键的形成1 1、肽是氨基酸的链状聚合物、肽是氨基酸的链状聚合物 侧链侧链N-末端末端C-末端末端主链骨架主链骨架HOH氨基酸残基的氨基酸残基的氨基酸残基的氨基酸残基的R R R R基构成多肽链的基构成多肽链的基构成多肽链的基构成多肽链的侧链侧链侧链侧链部分,参与形成肽部分,参与形成肽部分,参与形成肽部分,参与形成肽键的原子与键的原子与键的原子与键的原子与-碳原子一起构成其碳原子一起构成其碳原子一起构成其碳原子一起构成其主链骨架主链骨架主链骨架主链骨架,保留了完,保留了完,保
11、留了完,保留了完整的整的整的整的-羧基的末端称羧基末端或羧基的末端称羧基末端或羧基的末端称羧基末端或羧基的末端称羧基末端或C-C-C-C-末端末端末端末端;保留了完整;保留了完整;保留了完整;保留了完整的的的的-氨基的末端称氨基末端或氨基的末端称氨基末端或氨基的末端称氨基末端或氨基的末端称氨基末端或N-N-N-N-末端末端末端末端2 2、蛋白质是大分子肽、蛋白质是大分子肽区分蛋白质和多肽:区分蛋白质和多肽:a a、分子量小于、分子量小于10kDa10kDa的是多肽,大于的是多肽,大于10kDa10kDa的是蛋白质。的是蛋白质。胰岛素例外胰岛素例外b b、一个多肽分子只有一条肽链,而一个蛋白质分
12、子往、一个多肽分子只有一条肽链,而一个蛋白质分子往往不止一条肽链往不止一条肽链c c、多肽的生物活性可能与其构象无关,蛋白质则不然、多肽的生物活性可能与其构象无关,蛋白质则不然d d、许多蛋白质含有辅基成分,多肽一般不含、许多蛋白质含有辅基成分,多肽一般不含蛋白质分子量蛋白质分子量/110/110氨基酸数目氨基酸数目 3 3、一些重要的肽、一些重要的肽 抗氧化剂:谷胱甘肽抗氧化剂:谷胱甘肽 激素:抗利尿激素、血管紧张素激素:抗利尿激素、血管紧张素、催产素、促肾、催产素、促肾上腺皮质激素、内啡肽、脑啡肽上腺皮质激素、内啡肽、脑啡肽 生长因子生长因子谷胱甘肽的结构谷胱甘肽的结构Glu-Cys-Gl
13、y二、蛋白质的一级结构二、蛋白质的一级结构此外,蛋白质一级结构是很多遗传性疾病的分子基础,此外,蛋白质一级结构是很多遗传性疾病的分子基础,也可以用以阐明生物进化史也可以用以阐明生物进化史1.定义 1969年,国际纯化学与应用化学委员会(IUPAC)规定:蛋白质的一级结构指蛋白质多肽连中AA的排列顺序,包括二硫键的位置。2.意义 三、蛋白质的二级结构三、蛋白质的二级结构1.1.二级结构的定义二级结构的定义蛋白质的二级结构是指多肽链的主链本身蛋白质的二级结构是指多肽链的主链本身通过氢键沿一定方向盘绕、折叠而形成的通过氢键沿一定方向盘绕、折叠而形成的构象构象.它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形它只
14、涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。成的氢键。(注注:二级结构不涉及侧链的构二级结构不涉及侧链的构象象)主要有主要有-螺旋、螺旋、-折叠、折叠、-转角、无规卷曲转角、无规卷曲等等2.2.肽单元与肽平面肽单元与肽平面 肽键属于单键,但具有部分双键刚性的性质,肽键属于单键,但具有部分双键刚性的性质,不能自由旋转。与肽键相连的原子始终处不能自由旋转。与肽键相连的原子始终处在同一个平面,称为在同一个平面,称为“肽平面肽平面”(CCONHCCCONHC)肽单元肽单元:肽键与相邻的两个:肽键与相邻的两个 -碳原子所组碳原子所组成的基团成的基团 o o C CC C NHC C O O -C CC C
15、 NHC C+肽键平面肽键平面肽键平面肽键3.-3.-螺旋螺旋 -螺旋(螺旋(-helix-helix)是指)是指肽键平面通过肽键平面通过-碳原子的碳原子的旋转,主链原子盘绕成右旋转,主链原子盘绕成右手螺旋,螺旋上升一圈大手螺旋,螺旋上升一圈大约需要约需要3.63.6个氨基酸残基,个氨基酸残基,螺距为螺距为0.54nm0.54nm。相邻两个。相邻两个螺旋之间肽键的螺旋之间肽键的C=OC=O与与H HN N形成氢键,从而使形成氢键,从而使-螺旋螺旋能够稳定能够稳定0.50nm0.54nm氢键氢键-碳原子碳原子侧链侧链-螺旋(螺旋(-helix-helix)结构示意图)结构示意图4.-4.-折叠折
16、叠 -折叠(折叠(-sheet-sheet)是蛋白质分子中肽链)是蛋白质分子中肽链相对伸展的一种结构形式,其主链通过肽相对伸展的一种结构形式,其主链通过肽键平面折叠成锯齿状。若干肽链之间或一键平面折叠成锯齿状。若干肽链之间或一条肽链内的若干肽段所形成的条肽链内的若干肽段所形成的-折叠在相折叠在相邻主链骨架的邻主链骨架的C=OC=O和和H HN N之间形成氢键,使之间形成氢键,使其构象稳定。其构象稳定。-折叠可以是平行的,也可以是反平行的。折叠可以是平行的,也可以是反平行的。平行平行反平行反平行俯俯视视侧侧视视-折叠(折叠(折叠(折叠(-sheet-sheet-sheet-sheet)结构示意图
17、)结构示意图)结构示意图)结构示意图5 5-转角转角 -转角(转角(-turn-turn)是指蛋白质分子中,肽链形成)是指蛋白质分子中,肽链形成180180的回折,构成一个转角,其中第的回折,构成一个转角,其中第1 1个氨基酸个氨基酸残基的残基的C=OC=O与第与第4 4个氨基酸残基的个氨基酸残基的H HN N之间形成氢之间形成氢键,使构象稳定。第二个氨基酸通常为脯氨酸键,使构象稳定。第二个氨基酸通常为脯氨酸6 6无规卷曲无规卷曲 无规卷曲(无规卷曲(random coilrandom coil)是指蛋白质分子中的某)是指蛋白质分子中的某些肽段,其走向没有规律可循,肽链的肽键平面些肽段,其走向
18、没有规律可循,肽链的肽键平面不规则排列,形成较为松散的二级空间结构不规则排列,形成较为松散的二级空间结构-转角(转角(-turn-turn)结构示意图)结构示意图7 7、超二级结构与结构域、超二级结构与结构域 超二级结构是指二级结构单元进一步聚集和组合超二级结构是指二级结构单元进一步聚集和组合在一起,形成规则的二级结构聚集体,如在一起,形成规则的二级结构聚集体,如、等,称为超二级结构又叫模序等,称为超二级结构又叫模序(motifmotif)。它是蛋白质从二级结构延伸到三级结)。它是蛋白质从二级结构延伸到三级结构的一个新的结构层次。如亮氨酸拉链和锌指结构的一个新的结构层次。如亮氨酸拉链和锌指结构
19、。构。超二级结构类型超二级结构类型 X 四、蛋白质的三级结构四、蛋白质的三级结构三级结构三级结构是指在一条完整的蛋白质多肽链上,在是指在一条完整的蛋白质多肽链上,在一级结构中相距较远的一些氨基酸依靠非共价键一级结构中相距较远的一些氨基酸依靠非共价键及少数共价键相互结合,使多肽链在二级结构的及少数共价键相互结合,使多肽链在二级结构的基础上进一步折叠,形成特定的空间结构。基础上进一步折叠,形成特定的空间结构。维系三级结构的化学键主要有氢键、疏水键、离维系三级结构的化学键主要有氢键、疏水键、离子键、二硫键等次级键。蛋白质的多肽链在形成子键、二硫键等次级键。蛋白质的多肽链在形成三级结构时,其非极性的疏
20、水侧链形成疏水核,三级结构时,其非极性的疏水侧链形成疏水核,而大多数极性基团则分布在分子的表面,形成亲而大多数极性基团则分布在分子的表面,形成亲水区。水区。由一条多肽链构成的蛋白质只有形成三级结构才由一条多肽链构成的蛋白质只有形成三级结构才可能具有生物活性可能具有生物活性结构域结构域:许多蛋白质的三级结构中存在着一个或:许多蛋白质的三级结构中存在着一个或多个近似球体的折叠区,它们在空间上是独立的,多个近似球体的折叠区,它们在空间上是独立的,可以通过对多肽链的适当切割与分子的其它部分可以通过对多肽链的适当切割与分子的其它部分分开,这种结构称为结构域分开,这种结构称为结构域现在现在,结构域的概念有
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